紫斑牡丹的花色虽然也包括红、粉、紫、白、黄、绿、蓝、黑和复色9 大色系，但实际上主要集中在白、红、粉、紫色四种花色，而且除部分白色外，其它颜色往往不够纯正。例如，黄色普遍偏白，盛开后更趋于白色；红色分为红紫、粉红色；蓝色多为蓝紫、粉蓝色；绿色盛开时绿白、绿粉色；黑色多为深紫色；复色的间色少而淡等等。所以，培育花色纯正的紫斑牡丹品种，特别是在大量增加以黄色为基调的各种颜色的基础上培育纯黄、纯绿、纯红、深黑和复色系的品种，应是紫斑牡丹育种的重要方向。
1. 材料介绍
紫斑牡丹，Paeonia rockii 花瓣基部有墨紫色或紫红色大斑点，花瓣较厚，香气较浓；植株高大，长势强壮；耐寒性强，病虫害少，适应性广。紫斑牡丹花朵硕大、花香浓郁、色彩缤纷绚丽，而且单瓣、半重瓣花型的雄蕊发达，花粉量多。因此除了观赏外，花瓣可以做食品、饮料、干花、提炼香精作化妆品；花粉精加工后作补品来食用。紫斑牡丹的枝、叶、花、果实等都含有较丰富的牡丹酚、芍药苷等药用成分，皆可以提取药物，用来代替以往的挖根取药，以便进一步地保护生态环境。
1987 年颁布的中国第一批珍稀濒危植物名录中，将矮牡丹、紫斑牡丹、黄牡丹列为国家三级保护植物。
2. 育种程序
2.1 引种
紫斑牡丹自然分布于甘肃省东南、陕西省西南、河南省西南、四川省西北、湖北省西部等地。最佳引种时间是10 月上旬至11 月上旬；裸根引种5 至15 年生的植株，用生根粉溶液处理有助于提高成活率，可达95％以上；不同品种间，引种方式及时间对成活率、生长和开花的影响没有差异。
繁殖一直是牡丹生产中的难题，嫁接是最适合北京地区的牡丹生产繁殖技术体系。紫斑牡丹可以嫁接繁殖，利用芍药实生根作砧木，在10 月采用单芽嫁接，结合种植前沙藏处理，成活率在90％以上。
紫斑牡丹可以在阳性、半阴和全阴的环境中生长开花，并保持原产地着花繁、枝条长等特点；可作为中下层灌木，与多种植物配合形成较好的景观。
大花黄牡丹（Plutea.var.ludlowii）：黄牡丹之变种。产西藏林芝县、米林县。
2.2 亲本的选择
亲本应该具备育种目标所需要的优良性状，双亲之间的优点、缺点要能相互弥补，优良性状要突出；还要通过多种方法来提高杂交结实率和杂种成苗率。
初步研究发现，紫斑牡丹的花色、花型、株高、株型和叶型等性状均受母性遗传较大，以其为母本杂交是该品种群特色不变的重要保证。母株应选择健壮的成年期植株，并在前一年加强水肥管理，促进花芽充分分化和发育。在立蕾后，及时输去株丛下部的花蕾及侧蕾，仅保留最健壮的顶花蕾继续生长作为授粉花朵，以便集中养分，保证授粉后种实的发育。母本———紫斑牡丹（革质花盘亚组）之祥云：花乳黄，质地细腻，皇冠型，花头直立，花径中等，外瓣舒展，平伸，瓣缘平滑，瓣基紫红色斑中等大小，斑缘整齐，花药残存，花丝白色，雌蕊微显，柱头乳黄。花浓香，花期中晚结实，品质优为上乘之品。（成仿云2002 年选育并命名）
父本———大黄花牡丹（肉质花盘亚组）：株型高大，可达2.5~3.5 米，叶片大型，小叶裂片较宽。花大，金黄色，花期5 月至6 月中旬。为毛莨科植物，黄牡丹的一变种，特产于我国雅鲁藏布江大峡谷长约100Km 的狭小范围内，既可药用，又可观赏。黄牡丹为渐危植物，被列为国家三级保护，而大花黄牡丹做为黄牡丹的一变种更属珍稀，其野生自然分布大部分在米林。
2.3 套袋
可在破绽期或初花期进行，由于紫斑牡丹为雌雄异熟，因此没有必要去雄，但是套袋的大小要以不影响花瓣张开为度。套带可用透明的硫酸纸制作，其上用针扎一些小孔通风透气，袋口要用棉线或回形针扎紧并固定在花梗上，以免昆虫进入和被风吹落。
2.4 花粉采集、处理及活性测定
在破绽期至初花期，从具有典型性状的父本植株上剪下发育良好的花朵，在室内除净花瓣、花萼及叶片后，放在干净的硫酸纸、白纸或培养皿上，于阴凉通风处自然干燥。当绝大部分花药开裂散粉时，轻轻抖动花头，收集花粉，分小袋包装后放入盛有硅胶等干燥剂的密闭塑料袋或广口瓶中，贴上标签，注明品种、日期，置于4-10 度冰箱中贮藏保存。最好能尽快授粉，贮藏时间较长（10 天以上）时，杂交前应通过花粉萌芽试验确认其生活力，以保证授粉效果。
在牡丹杂交育种中，经常会遇到花期不遇的情况，解决一问题的最好方法是在同一地区或附近地区不同气候（海拔）条件下，分别种植杂交亲本，这样不同花期以及不同种源之品种的花期会相互交叉，给杂交带来方便。也可以通过促成、抑制栽培，改善生长环境，促使雄蕊花期提前或退后，以便减少花粉贮藏时间，提高杂交授粉成功率。
2.5 授粉
在盛花期柱头大量分泌粘液时，每天于上午10：00 之前（此时柱头上粘液新鲜充分）授粉一次，连续重复3 天共3 次。具体方法是取下套袋，用药用棉签蘸取花粉，均匀涂于柱头表面，然后再重新套好袋即可。
2.6 授粉后管理
在授粉后3-5 天后柱头干燥、表面粘液硬化时可尽早去除套袋。然后观察和加强日常管理，防止病虫害及人为对母株的破坏，当果实和种子发育到一定程度时，适时采收。
2.7 杂交档案建立
仔细记录杂交授粉的每一个环节，建立工作档案，是杂交育种工作的一项重要内容。记录内容包括：套袋时间、花粉采集或贮藏时间，授粉日期以及父母本名称、杂交种子收藏日期及数量等，其中在套袋时还要在母株上挂上标签，标明杂交组合编号和父母本名称，以防止混杂。
2.8 远缘杂种的选择
远缘杂交对后代必须进行严格的选择，才能获得人类需要的性状表现稳定的新类型。
根据远缘杂种的若干特点，选择必须注意掌握如下几个原则：
（1）扩大杂种的群体数量。
（2）增加杂种的繁殖世代。
（3）继续进行杂交选择。
（4）培育与选择相结合。
3. 远缘杂交不亲和性的克服方法
3.1 亲本的选择
选择第一次开花的幼龄杂种实生苗作母本，若双亲均是第一次开花的幼龄杂种，则更为有利。
3.2 采用特殊的授粉方法
重复授粉法：即在同一母本的花蕾期、开花期和临谢期等不同时期，进行多次重复授粉，以利用雌蕊不同发育程度、受精选择性的差异，促进受精结籽。
3.3 生理接近法
常用的方法是在杂交前，将亲本双方先嫁接成一体，通过接穗和砧木间的营养交流，使差异得到缓和，开花后再进行有性杂交。
3.4 媒介法
利用亲缘关系与两亲本都较近的第三个种作为桥梁，先与某一亲本杂交产生杂种，然后用这个杂种再与另一亲本杂交。“桥梁种”起到有性媒介的作用，从而改善结实情况。
3.5 柱头移植和花柱短截法
柱头移植的方法通常有两种：一是将父本花粉先授于同种植物柱头上，在花粉管尚未完全伸长前，切下柱头，移植到异种的母本花柱上；二是先进行异种柱头嫁接，待一二天愈合后再行授粉。花柱短截法是把母本花柱切除或剪短，把父本花粉直接撒在切面上，或将花粉的悬浮液直接注入子房。
3.6 化学药剂的应用
一般用赤霉素、萘乙酸、硼酸等化学药剂，在授粉后涂抹或喷洒处理母本的花柱和子房基部，能促进花粉发芽和花粉管生长，有利于杂交的成功。
3.7 应用温室或保护地杂交，改善授粉受精条件
3.8 花粉预先用低剂量辐射处理
花粉用低剂量射线处理后，活性增加，表现花粉发芽率提高，花粉管生长迅速, 再行杂交可以提高杂交成功率。
4. 远缘杂种不育性的克服方法
（1）杂种胚的离体培养。
（2）杂种染色体的加倍。
（3）回交法。
（4）改善营养条件。
（5）人工辅助授粉。
（6）延长培育世代、加强选择。
5. 所需面对的问题
紫斑牡丹与其他牡丹一样，胚（种子）萌发和幼苗生长都比较缓慢，用传统杂交技术培育一个新品种需十多年。因此，如何缩短牡丹的育种周期，是包括远缘杂交在内的各种育种方法所需面对的问题。
离体胚培养技术能够有效克服牡丹的休眠，促进幼苗提前形成，用过胚培养获得的5-6 个月的幼苗，其生长发育的程度与通过种子萌发形成的2 年生幼苗相同，主要表现在幼苗的茎明显伸长。在紫斑牡丹的胚培养中，我们也取得了初步成功。因此，离体胚培养显示出的使幼苗提前形成和生长明显加快，对缩短包括紫斑牡丹在内的牡丹育种周期有更为突出的重要意义。
