一、加强苗木检疫，带病苗木要严禁出圃。对出圃或外来苗木应抛弃病株，若发现可疑苗木，可用500～2000ppm的链霉素液浸泡30分钟，或用1%硫酸铜液浸5分钟、2%石灰水浸1至2分钟，用清水冲洗后栽植。在栽植苗木时，应避免从病区引进苗木或插穗，若有带病苗木应彻底清除烧毁。
二、建立无病苗木繁育基地，种植前每亩用硫酸亚铁15公斤进行土壤消毒。
三、对种条或插穗，用0.5％的高锰酸钾溶液浸泡10分钟进行杀菌。
四、加强栽培管理。适宜于根癌病发生的中性或微碱性土壤，应多施有机肥以提高土壤酸度，改善土壤结构；在进行中耕除草等操作时应尽量少伤根或损伤花木茎蔓基部；注意及时防治地下害虫和土壤线虫，减少虫伤；雨后注意排除积水，降低土壤湿度，促进花木生长，提高抗病性。刮除病瘤或清除病株。发现苗圃或栽植花木感染病菌后，应及时扒开周围土壤，用刮刀将肿瘤彻底切除，直至露出无病的木质部，并用高浓度的石硫合剂或波尔多液保护伤口，以免再感染。对无法治疗的重病株应及时清除并彻底收拾残根，集中烧毁处理。对轻病株可用“402”抗菌剂300～400倍液灌根，或切除瘤体后用500～2000ppm的链霉素、500～1000ppm土霉素、5%硫酸亚铁等涂抹伤口。另据报道，用甲冰碘液（甲醇50份、冰醋酸25份、碘片12份）涂瘤有治疗作用。还可施放射形土壤杆菌84号进行生物防治。
五、嫁接时应避免伤口接触土壤。嫁接工具可用75%酒清或1%甲醛溶液消毒灭菌。
六、发病期间可用50％的多菌灵灌根或喷干。及时中耕除草，消灭地下害虫。中耕除草时要防止伤根和伤干，以防病菌从伤口或虫口侵入。
